Keiji Fukuda (jap. 福田 敬二 Fukuda Keiji; * 1955 in Tokio, Japan) ist ein US-amerikanischer Mediziner japanischer Abstammung mit dem Spezialgebiet der Influenzaforschung. Fukuda trat im März 2009 die Stelle als stellvertretender Generaldirektor für Gesundheitssicherheit und Umwelt ad interim bei der World Health Organization (WHO) an. Zum 1. September 2010 übernahm er diese Position permanent. Fukuda ist seit 2005 für die WHO tätig. Er war von 2006 bis 2008 zunächst Koordinator des globalen Influenza-P